NB. Секвенирование — это определение последовательности нуклеотидов в гене. Этот метод применяется для того, чтобы. выявить новые инфекционные агенты и вариации их генотипов, определить   структуру возбудителя, его генотипы и субтипы

Наиболее часто возникает необходимость провести секвенирование европейского штамма вируса РРСС. Одним из вариантов является секвенирование по Сэнгеру.  В качестве мишеней для специфических праймеров и зондов используют ген ORF 7, который является наиболее консервативным внутри каждого генотипа, но позволяет дифференцировать европейский и американский генотипы вируса РРСС.

В результате секвенирования европейского штамма определяют гомологию исследуемого образца с референсным штаммом Lelystad и относят его к тому или иному субтипу.

Результаты данного исследования могут быть использованы для
создание базы данных о мутациях вируса на конкретном свинокомплексе и корректировки ветеринарных мероприятий.

 

Comments are closed.